Instalasi Farmasi adalah sebuah bagian pada Rumah Sakit PELNI yang mengakomodir semua kebutuhan obat-obatan ,hingga alat kesehatan yang dibutuhkan pasien dalam proses penyembuhan. Instalasi farmasi sendiri memiliki beberapa titik layanan, guna mengurai antrian yang panjang dalam pendistribusian Obat untuk pasien.