Kamar Operasi adalah layanan Rumah Sakit PELNI unit khusus yang digunakan untuk melakukan tindakan pembedahan, baik elektif maupun akut, yang membutuhkan keadaan steril. Rumah Sakit PELNI memiliki 8 kamar bedah, terdiri dari 1 Kamar Operasi Besar & 7 Kamar Operasi Reguler

Dengan kemampuan pelayanan hingga 60 operasi per hari, didukung oleh lebih dari 60 Dokter Bedah sesuai bidang spesialisasinya dan 11 Dokter Spesialis Anestesi

Kamar bedah Rumah Sakit PELNI dapat digunakan untuk berbagai tindakan operasi, saat ini kamar bedah RS PELNI dapat mengerjakan tindakan Atroscopy, Laparascopy  hingga Operasi katarak Fakoemulsifikasi.